Tùy theo yêu cầu của khách hàng, mật ong sẽ được đóng gói trong Phuy, can, chai hủ...
Thông thường xuất khẩu mật ong nguyên liệu được đóng gói trong phuy 280-290 Kg. Phuy phải đạt chất lượng an toàn thực phẩm, bên trong được tráng lớp epoxy.
Phuy phải được tráng bằng nước sạch, để khô ráo nước trước khi đóng gói.
Chai lọ thủy tinh được rửa sạch, sấy tiệt trùng trước khi chiết rót.
Các thiết bị chiết rót luông được vệ sinh sạch, và bọc các vòi rót khi không làm việc.
Các quy trình chiết rót được kiểm soát chặt chẽ.